公路：滬杭甬高速公路、320國道（上海—昆明）穿境而過，善江一級公路（平湖—嘉善—江蘇黎里）連接318國道（上海—西藏）；在建的杭州灣大通道（上海—寧波）、申嘉湖高速公路（上海—嘉興—湖州）及規劃中的蘇通高速公路（嘉興—蘇州—南通）經過縣境。

空運：西有杭州蕭山國際機場（120公里），東有上海虹橋國際機場（72公里）、上海浦東國際機場（105公里）。

鐵路：滬杭鐵路復線穿境而過，設有貨運、客運站（屬上海鐵路局），可直達全國28個省市。

海運：南有萬噸級的東方大港乍浦港（35公里），北有國際集裝箱運輸大港上海港（120公里），東南處有國家重點開發建設的四大國際深水中轉港之一的寧波港（直線距離120公里），杭州灣跨海大通道貫通后也將成為嘉善的主要出入港之一。

河運：杭申甲級航線穿越縣境，屬國家4級內河航道，單船通行能力為300-500噸級，并連接京杭大運河。